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人呼吸道合胞病毒感染的SPC-A1细胞相关基因 zzz171con的电子克隆与分析
张其威1,李蕾1,赵东赤1,张楚瑜1,李乐2,游上游2,黄静宁2
1. 武汉大学病毒学国家重点实验室,湖北,武汉,430072;2. 武汉市儿童医院,湖北,武汉,430020
摘要:
采用mRNA差异显示RT-PCR方法克隆到人呼吸道合胞病毒感染的SPC-A1细胞中相关的50个表达序列标签,其中一个片段g17-1在HRSV感染的细胞中高表达.利用生物信息学的方法对g17-1进行分析鉴定,推测是一个新基因.利用电子克隆,得到一全长2101bp的cDNA,对其ORF、启动子、电子表达谱、染色体定位以及所编码的蛋白进行分析,结果表明,该cDNA含有1个ORF,与人类假定蛋白XP-097121同源性达90%,定位于人17号染色体,在肿瘤细胞、腺癌细胞、扁桃体初级B细胞中表达,其编码的蛋白预测定位于细胞核内,推测其与细胞抗病毒感染有一定的关系.
关键词:  生物信息学  人呼吸道合胞病毒  电子克隆
DOI:
分类号:Q93
基金项目:
In Silico Cloning and Analysis of zzz171con Gene in SPC-A1 Cells Responsive to Human RSV Infection
Abstract:
Key words: